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当阳鱼腥草花叶病病原分子鉴定

发布日期:2024/10/21 16:01:31 浏览次数:
栏目:试验研究
作者:周洁,吴方华,燕飞,齐传东,郭凤领,吴金平
关键词:鱼腥草;黄瓜花叶病毒;sRNA 深度测序;RT-PCR
DOI:10.16861/j.cnki.zggc.202423.0810
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摘 要:明确当阳鱼腥草花叶病致病菌种类,为当阳鱼腥草花叶病的田间防治提供依据。采集鱼腥草花叶叶片提取 当阳鱼腥草典型病样的总 RNA,利用 sRNA 深度测序,结合生物信息学分析初步确定病原菌,利用该病毒外壳蛋白 (CP)特异性引物进行 RT-PCR 检测,所得序列进行 BLAST 比对和系统进化树构建,以进一步确定病原菌种类。利 用 sRNA 深度测序和生物信息学初步确定鱼腥草花叶病致病菌为黄瓜花叶病毒(CMV),特异性引物扩增得到 878 bp 特异性条带,经 BLAST 比对发现其与已发表的 CMV 序列高度同源,相似性最高达 97.84%。通过 CMV 病毒 CP 基因的核苷酸序列构建系统进化树可得鱼腥草花叶病病毒属于 CMV 亚组 II。引起鱼腥草花叶病的病原属于黄瓜 花叶病毒 II 亚组,研究结果为鱼腥草花叶病防治提供了理论基础。