西瓜 NPR 基因家族的鉴定及其在盐胁迫下的表达分析

  摘 要：以拟南芥 NPR 基因家族成员蛋白序列为查询序列，在西瓜基因组数据库中鉴定西瓜 NPR 基因家族成员，并 对其进行生物信息学分析及盐胁迫下的表达分析。共鉴定到 4 个成员，将其命名为 ClNPR1~ClNPR4，其编码蛋白 的理化性质、保守功能结构域、重要氨基酸残基及 motif 分析结果与其他物种有较高的一致性，顺式作用元件分析 显示，ClNPRs 与非生物胁迫相关。300 mmol·L^-1 NaCl 处理耐盐材料和盐敏感材料，分别取盐胁迫 0、8、24 h 的叶片 进行 4 个 NPR 基因的表达模式分析，结果表明，ClNPR1 在盐敏感和耐盐材料中都显著上调表达，但盐胁迫 24 h， ClNPR1 在盐敏感材料中显著下调表达，在耐盐材料中虽然下调但还保持较高的表达水平，且在耐盐材料中的表达 量显著高于盐敏感材料；盐胁迫 24 h，ClNPR2 和 ClNPR3 在盐敏感和耐盐材料中都显著上调表达，在耐盐材料中的 表达量均显著高于盐敏感材料。推测 ClNPRs 基因在西瓜响应盐胁迫的过程中扮演重要角色。