淹水胁迫下甜瓜幼苗的转录组测序及生物信息学分析

  摘要：涝害是全球范围内危害最广、频率最高的自然灾害。葫芦科瓜类作物耐涝性较差，尤其是甜瓜。甜瓜属一年生草本葫芦科植物，喜温热气候，对涝湿环境耐受能力较弱，是我国重要经济作物。甜瓜种植区域遭受持续多雨或者涝灾的影响，可能会导致减产甚至绝收。以实验室甜瓜耐涝种间杂交高代种M13-06-3为试材，对其进行淹水胁迫，并利用转录组测序及实时荧光定量PCR对其根系组织进行差异表达基因分析。结果表明，淹水胁迫后，耐涝型甜瓜品种M13-06-3筛选出9037个差异表达基因，其中4529个DEGs上调，4508个DEGs 为下调基因。通过实时荧光定量检测发现MELO3C003917、MELO3C020588、MELO3C008314、MELO3C025360、MELO3C021658 这5个基因定量检测数据与转录组数据的趋势基本一致，初步推测这5个基因为甜瓜耐涝基因。研究结果可为进一步挖掘与甜瓜耐涝相关的基因奠定基础。