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基于GWAS 分析挖掘甜瓜熟性相关候选基因

发布日期:2026/5/15 16:35:09 浏览次数:
栏目:试验研究
作者:王红梅,解华云,李桂芬,覃斯华,张德梅,洪日新,何毅,柳唐镜,叶云峰,黄金艳
关键词:甜瓜;熟性;早熟;全基因组关联分析
DOI:10.16861/j.cnki.zggc.2025.0758
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摘 要为挖掘甜瓜熟性相关遗传位点及候选基因,加速甜瓜早熟新品种的选育进程,以151份不同熟性的厚皮甜瓜为材料,采用重测序的方法,对甜瓜熟性性状进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),定位熟性显著关联位点。结果表明,151份材料中,早熟材料有36份,共获得高质量SNP位点2 165 342个,MLMQK)模型筛选到与甜瓜熟性性状显著关联的SNP位点55个,这些位点上下游100 kb范围内共包含等位基因240个。结合功能注释和富集分析,筛选到的基因主要参与苯丙烷生物合成、次级代谢物生物合成、脂肪酸代谢、氨基酸生物合成和植物激素信号转导等过程。其中关联信号最强的2SNP位点分别在4号和12号染色体上,与4号染色体SNP位点紧密相关的基因为MELO3C009181MELO3C009179,与12号染色体SNP位点紧密相关的基因为MELO3C002391,其中MELO3C009181LAX2)编码类生长素转运蛋白,MELO3C002391PER7)编码过氧化物酶,可作为调控甜瓜熟性的候选基因。本研究结果为甜瓜熟性育种和早熟品种选育奠定了分子基础。