- 栏目:试验研究
- 作者:陈筱瑶,冯梦娇,黄欣,张瑞青,代雪,王家发,张显,李军华,霍治邦,魏春华
- 关键词:西瓜;TALE 基因家族;生物信息学;表达分析
- DOI:10.16861/j.cnki.zggc.2024.0109
- 全文: PDF (下载次数:) 摘要(点击次数:)
摘 要:TALE基因家族在调控花器官发育、花分生组织形成、器官形态发生、果实发育、植物非生物胁迫响应及激素响应中发挥重要作用。利用生物信息学的方法鉴定了西瓜TALE基因家族成员,并分析了其基因结构、系统发育树、保守基序、顺式作用元件、组织特异性表达,以及低温胁迫和干旱胁迫后基因的表达情况,为西瓜TALE基因家族的功能研究和利用提供了理论依据。结果表明,西瓜TALE 基因家族共包含19个成员。系统发育分析将ClTALE家族分为BEL1-like和KNOX两个亚家族,KNOX亚家族又可进一步划分为两个分支Class I 和Class II。顺式作用元件分析表明,ClTALE基因的启动子中富含光、植物激素和非生物胁迫响应的顺式元件,其中光响应元件最多。西瓜组织特异性表达分析表明,ClBLH09在根中高表达,ClBLH01在卷须、雌花和雄花中高表达,因此西瓜TALE基因家族可能参与了西瓜的生长发育过程。低温胁迫(0、3、6、12、24、36 和48 h)和干旱胁迫(0、1、2、3、4、5、6、7 和8 d)不同时间后基因的表达分析表明,ClBLH08 和ClKN02 在低温胁迫下呈现上调趋势,ClBLH04和ClBLH05在干旱胁迫下呈上调的趋势,因此西瓜TALE基因家族可能在低温胁迫和干旱胁迫中发挥作用。