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中国南瓜CmoAux/IAA 基因的克隆和表达特征分析

发布日期:2024/10/21 11:35:02 浏览次数:
栏目:试验研究
作者:任广乾,刘正响,韩圆圆,陈碧华,李新峥,李庆飞
关键词:中国南瓜;Aux/IAA;基因克隆;生物信息学分析;亚细胞定位
DOI:10.16861/j.cnki.zggc.2024.0297
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摘要:在前期对中国南瓜败育雌蕊和正常雌蕊进行转录组分析发现,CmoAux/IAA 基因可能参与了雌花发育,为进一步探究其生物学功能,利用同源序列克隆法从中国南瓜中克隆得到全长为600 bp 的CmoAux/IAA 基因,该基因编码199 个氨基酸;保守结构域分析结果表明,其属于Aux/IAA 家族,包含结构域Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ;该蛋白无信号肽和跨膜结构。多序列比对和系统进化树分析结果显示,CmoAux/IAA 氨基酸序列与印度南瓜XP_022986212.1 的氨基酸序列、美洲南瓜XP_023513171.1 的氨基酸序列亲缘关系较近,相似度高达98.01%、96.50%。拟南芥原生质体亚细胞定位结果显示,CmoAux/IAA 蛋白定位于细胞核和细胞质。实时荧光定量结果显示,该基因具有组织表达特异性,主要在南瓜植株生长点及雌花柱头中表达,柱头中的相对表达量是雄蕊的137 倍,在叶和根中不表达,其可能在植株生长点幼嫩组织分化或雌花发育过程中发挥着重要作用。