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基于 SCoT 分子标记的 61份加工型黄瓜种质资源遗传多样性分析及 DNA 指纹图谱构建

发布日期:2024/4/22 17:14:40 浏览次数:
栏目:试验研究
作者:王宏利,赵久成,赖淼,卢家仕,凌启昌,肖锦华,张华,付鑫锋
关键词:黄瓜;SCoT 分子标记;亲缘关系;遗传多样性;DNA 指纹图谱
DOI:10.16861/j.cnki.zggc.202423.0760
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摘 要:为探明加工型黄瓜种质资源的亲缘关系及遗传多样性,为新品种选育提供理论依据,采用目标起始密码子多态性标记(SCoT)技术,以61份加工型黄瓜种质资源为试验材料,进行遗传多样性分析并构建 DNA指纹图谱。 结果表明,从100SCoT引物中筛选出8条扩增条带清晰、多态性高且重复性好的引物;利用筛选出的引物对61份黄瓜种质基因组DNA 进行PCR扩增,共扩增出238个位点信息,其中多态性位点227个,平均多态性位点百分比为95.38%;采用NTSYS-pc 2.1 软件计算得出供试的61份材料间的遗传相似系数分布在0.588~0.920之间,遗传相似系数最小的材料分别是34号与55号,二者在瓜色、叶片形状及果实形状方面存在较大差异,说明两者亲缘关系最远。基于遗传相似系数对其进行UPGMA 聚类分析和树状图绘制,在相似系数0.735处,可将其划分为7个类 群,说明61份黄瓜种质材料背景存在差异,但多数地域来源相近、生境相似地区的种质被聚在同一类群。利用2对特异性较大的引物SCoT 12SCoT 83构建的DNA 指纹图谱可单独鉴别出61份黄瓜种质资源,该图谱可为黄瓜 分类与鉴定提供科学依据。