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番茄SlMYB48 基因生物信息学及表达分析

发布日期:2024/4/22 17:12:40 浏览次数:
栏目:试验研究
作者:刘佳凤,郭晓青,王桂强,王虹云,朱桐,曹守军,姚建刚,张丽莉,张瑞清,赵婧,李涛
关键词:番茄;SlMYB48;表达分析;定位
DOI:10.16861/j.cnki.zggc.202423.0652
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摘  要:MYB 转录因子是植物转录因子家族中数量最多、用途最广的成员之一,为挖掘更多番茄(Solanum lycopersicum)MYB 转录因子家族成员信息,初步探究其表达模式及功能,以番茄Ailsa Craig 为试材,采用RT-PCR 的方法克隆SlMYB48 基因,并对其进行生物信息学及表达、定位分析。结果表明,番茄SlMYB48 基因的开放阅读框(ORF)长度为708 bp,编码235 个氨基酸,在番茄的根中表达量最高,叶中次之。SlMYB48 蛋白含有保守的MYB 结构域,定位于细胞核中,属于不稳定、亲水性蛋白。对SlMYB48 启动子分析,发现其含有大量的逆境响应元件,qRT-PCR 及RNA-seq 数据库分析结果表明,高盐、生物逆境胁迫条件下,SlMYB48 基因表达量均随处理时间延长而升高,干旱胁迫条件下表达量下降,推测其可能参与番茄生物及非生物逆境胁迫反应。研究结果为进一步深入探究番茄SlMYB48 基因的功能及作用机制提供了参考。