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辣椒BAM 家族基因鉴定及表达模式分析

发布日期:2025/12/2 9:15:59 浏览次数:
栏目:试验研究
作者:李宁,尹延旭,高升华,王畅,葛长军,谢勇,王飞,姚明华
关键词:辣椒;BAM 基因家族;基因表达;生物信息学
DOI:10.16861/j.cnki.zggc.2025.0347
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 摘要:β-淀粉酶(BAM)家族基因广泛存在于多种植物中,在植物生长、非生物胁迫响应等方面发挥重要作用。为进一步挖掘辣椒BAM 家族成员信息,探究分析其表达模式及基因功能,利用生物信息学手段对辣椒CaBAM 基因家族进行全基因组鉴定,并对基因结构、系统进化及表达模式进行分析。结果表明,辣椒中共有10 个CaBAM 基因,均为亲水性蛋白,分布于细胞核、细胞质、线粒体、叶绿体和质膜中。系统发育分析将CaBAM 基因家族划分为6 个组,催化残基Glu-186 和Glu-380 的保守性高于Flexible loop 和Inner loop。CaBAM 基因启动子区含有多个与逆境、发育等相关的顺式作用元件,转录组和在低温胁迫下的qRT-PCR 验证试验分析表明,CaBAM 基因在不同组织和非生物胁迫下存在差异表达,CaBAM4CaBAM5CaBAM6 可能在辣椒生长发育及逆境胁迫中发挥作用。研究结果为进一步深入研究辣椒CaBAM 基因家族功能提供了参考。